激光与普通的光一样具有生物效应(熟效应、光效应、压力效应和电磁场效应)，这种生物效应在给人类带来益处的同时也会对如眼睛、皮肤以及神经系统等人体组织造成直接或间接的损害。为了确保操作光纤激光焊接机时的安全就必须对激光危害严加控制，做好工程控制、个人防护及安全管理。
　　1、工程控制
　　工程控制是对激光器或者激光加工系统在结构上所采取的安全措施，主要包括：防护罩——用以防止工作人员接受超过最大允许照射量；安全连锁——指与防护罩相连的可避免辐射的自动装置；安全光路——对辐射可能引起燃烧或次级辐射的光路予以封闭；钥匙开关——泛指取下钥匙时激光器停止运转；光束终止——为了使激光束不超出受控的加工作业区可使用光束终止器或衰减器。
　　2、个人防护
　　主要指穿戴耐火耐热的激光防护服，配戴可以选择性地衰减特定激光波长的激光防护眼镜、配戴用于紫外激光源的激光防护面罩、配戴可避免直射或散射激光造成损害的激光防护手套。
　　3、安全管理
　　安全管理包括设置专门机构或人员，明确职责、权利，包括安全培训和医学监督等。